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Kolb Lab Heisenberg DFG

Netzwerke

Die AG Kolb befindet sich am Institut für Pharmazeutische Chemie der Philipps-Universität Marburg.

Wir sind des Weiteren Mitglied in GLUE,
dem Schwerpunktprogramm 2363 "Molecular Machine Learning",
SYNMIKRO,
im SFB/Transregio 81 (TRR81),
und DRUID.
Wir sind auch Teil des Netzwerks ERNEST, dem "European Research Network on Signal Transduction".
Gemeinsam mit den Arbeitsgruppen von Jana Selent und Michel Bouvier untersuchen wir "biased ligands" des 5-HT2A Rezeptors im Rahmen des ERANET NEURON Projekts PSYBIAS. Dieses Projekt wird vom Bundesministerium für Bildung und Forschung mit Förderkennzeichen 01EW1909 gefördert.



Die AG war stark an COST Action CM1207 "GLISTEN: GPCR-Ligand Interactions, Structures, and Transmembrane Signalling: a European Research Network" beteiligt
und Teil von SynChemBio.
Die Arbeitsgruppe entstand durch die großzügige Förderung der DFG im Emmy Noether Programm. Emmy Noether DFG
[en][de]


Forschung

Docking
Word cloud wurde mit wordart.com aus Publikationszusammenfassungen erzeugt.

Kleine Moleküle werden häufig sowohl von der Natur als auch therapeutisch eingesetzt, um die Aktivität des Proteins an welches sie binden zu modulieren. Trotzdem werden viele Aspekte von Molekül:Protein Interaktionen überraschend schlecht verstanden. Polypharmakologie, d.h. das Binden eines Liganden an mehrere Proteine, tritt oftmals überraschend auf, obwohl diese Eigenschaft der eigentliche Grund für Wirksamkeit oder Nebenwirkungen eines Wirkstoffes sein kann. Auf der Seite der Proteine kann eine Punktmutation in der Bindetasche, was an sich nur eine kleine Veränderung darstellt, die Bindung eines Wirkstoffes verunmöglichen und damit Resistenzen bewirken. Es ist daher von grossem Interesse ein umfassendes Verständnis der Molekül:Protein Interaktionsprofile in molekularem Detail zu erhalten und diese Profile mit Signal- und Metabolismuspfaden zu korrelieren.

Docking von kleinen Molekülen ist unsere Hauptmethode, aber wir forschen auch in den angrenzenden Gebieten der Chemoinformatik und Molekulardynamik. Die Untersuchungen richten sich hauptsächlich auf Kinasen und G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPCRs).


Publikationen

Zuletzt veröffentlicht:
56 The extracellular N-terminus of natural receptor isoforms allosterically modulates GPR35-transducer coupling and mediates intracellular pathway bias.
Hannes Schihada*, Thomas M. Klompstra, Laura J. Humphrys, Igor Cervenka, Shamim Dadvar, Peter Kolb*, Jorge L. Ruas, Gunnar Schulte*
J. Biol. Chem. 2022, accepted.
55 Allosteric modulation of GPCRs: From structural insights to in silico drug discovery.
Margherita Persechino, Janik B. Hedderich, Peter Kolb*, Daniel Hilger*
Pharmacol. Ther. 2022, accepted. [pdf][review]
54 The pocketome of G-protein-coupled receptors reveals previously untargeted allosteric sites.
Janik B. Hedderich, Margherita Persechino, Katharina Becker, Franziska M. Heydenreich, Torben Gutermuth, Michel Bouvier, Moritz Bünemann, Peter Kolb
Nat. Commun. 2022, 13, 2567. [pdf]
53 Community guidelines for GPCR ligand bias: IUPHAR review 32.
Peter Kolb†,*, Terry Kenakin†,*, Stephen P. H. Alexander, Marcel Bermudez, Laura M. Bohn, Christian S. Breinholt, Michel Bouvier, Stephen J. Hill, Evi Kostenis, Kirill A. Martemyanov, Richard R. Neubig, H. Ongun Onaran, Sudarshan Rajagopal, Bryan L. Roth, Jana Selent, Arun K. Shukla, Martha E. Sommer, David E. Gloriam*
Br. J. Pharmacol. 2022, 179, 3651-3674. [pdf]
vollständige Liste

Mitarbeiterinnen & Mitarbeiter

Viviane Corrêa Santos [Ehemalige Gastwissenschaftlerin]
Matthäus Drabek [Doktorand]
Anja Flöser [Ehemalige Doktorandin]
Janik Hedderich [Doktorand]
Jonas Kammertöns [Doktorand]
Peter Kolb [Gruppenleiter]
Victor Lim [Doktorand]
Lea Löffler [Ehemalige Studentische Hilfskraft]
Stefania Monteleone [Ehemalige Postdoc]
Maria Giovanna Papadopoulos [Doktorandin]
Margherita Persechino [Doktorandin]
Naiá Porã Santos [Ehemalige Praktikantin]
Magdalena Scharf [Ehemalige Doktorandin]
Johanna Senst [Ehemalige Doktorandin]
Corey Taylor [Ehemaliger Doktorand]
Nicht auf dem Bild:
Frank Balzer [IT Administrator]
Pascal Büch [Praktikant]
Steffi Dörr [Laborantin Molekularbiologie]
Hans-Dieter Gerber [Chemielaborant]
Franziska Giese [Studentische Hilfskraft]
Shiva Mohajerani [Studentische Hilfskraft]
Anja Moser [Assistentin]
Jan-Niklas Pütz [Studentische Hilfskraft/MOS]
Klaus Reuter [apl Professor]
Hannes Schihada [Postdoc]
Aida Shahraki [Postdoc]
Jamal Shamsara [Postdoc Core Facility]

Lehre

Wir lehren in den Vorlesungen und Praktika der Pharmazeutischen Chemie. Des Weiteren nehmen wir Wahlpflichtpraktikantinnen und Wahlpflichtpraktikanten aus der Chemie und Pharmazie auf. Studierende mit einem starken Interesse an Computerberechnungen, Chemie und Biochemie, sowie deren Anwendung auf pharmazeutische Fragestellungen werden für B.Sc.-, M.Sc.- und Doktorarbeiten angenommen.

Scubidoo & Pingui


PrenDB


Daim – ein Programm zur Erzeugung von Molekülfragmenten


In der AG mitarbeiten




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